เดิมทีคลองนิน เป็นมัสยิดที่เก่าแก่อยู่ในเขตหมู่ 6 ต.เกาะลันตาใหญ่ ได้ก่อตั้งเป็นมัสยิดในปี พศ........    ซึ่งเดิมทีสมัยก่อน มัสยิดคลองหิน มัสยิดริมเล มัสยิดคลองโตบในปัจจุบัน จะมาละหมาดวันศุกร์ที่คลองนินบ้านทุ่งทั้งนั้น เพราะสมัยนั้นมีมัสยิดแค่แห่งเดียว แต่ปัจจุบัน สัปบุรุษมีการเพิ่มปริมาณเป็นจำนวนมาก และแยกกันอยู่ตามจุดต่างๆเนื่องจากมีความลำบากในการเดินทาง เลยมีการสร้างบาลาเซ๊าะและได้กลายเป็นมัสยิดในที่สุด แต่กุโบร์ยังใช้ฝังมัยยิตร่วมกันเหมือนเดิม

ตอนนี้มัสยิดบ้านคลองนินกำลังสร้างหลังไหม่ไกล้กับหลังเก่า เนื่องจากหลังเก่าเริ่มมีสภาพที่ทรุดโทรมและติดถนนมากเกินไป ซึ่งก่อสร้างยังไม่แล้วเสร็จและยังใช้มัสยิดหลังเก่าเป็นสถานที่ทำละหมาดเช่นเดิมไปก่อน

1. อีหม่าม

2.อีหม่าม

3.อีหม่ามย่าสาด หวังผล

4.อีหม่าม นรินทร์ สันม่าแอ

5.อีหม่าม ศราวุฒิ ก๊กใหญ่

6.อีหม่าม หมาดเตบ วะเจดีย์

7.อีหม่าม ก้อเหร็ม กสิคุณ